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Dresden科技大学BiA-PoL组生物图像分析函数集合。

项目描述

biapol-utilities

Python Version test Contributors codecov

德国Dresden科技大学DFG卓越集群“生命物理学”(PoL)BiA-PoL小组的实用函数集合。

用法

此库包含比较和可视化标签图像的函数。例如,比较标签图像就像这样简单

import biapol_utilities as biau

biau.label.compare_labels(ground_truth, segmented)

img.png

在另一个例子中,您可以像这样使用漂亮的颜色图可视化标签图像

import biapol_utilities as biau
from skimage.io import imshow

imshow(label_image, cmap=biau.labels_colormap(), vmin=0, vmax=labels.max())

img.png

我们在文档中提供了大多数功能的示例。这些示例也作为jupyter notebooks提供。

安装

使用pip安装biapol-utilities

pip install biapol-utilities

如果您想开发biapol-utilities,您可以像这样下载和安装它

git clone https://github.com/BiAPoL/biapol-utilities
cd biapol-utilities
pip install -e .

资源

致谢

开发biapol-utilities是一个社区努力的结果。我们感谢所有帮助开发和测试的人。此外,我们很乐意重新使用其他开源项目的代码。有关详细信息,请参阅第三方许可证文件夹

项目详情


下载文件

下载适用于您的平台的文件。如果您不确定选择哪个,请了解更多关于安装包的信息。

源分发

biapol-utilities-0.0.3.tar.gz (690.9 kB 查看哈希值)

上传时间 源代码

构建分发

biapol_utilities-0.0.3-py3-none-any.whl (13.7 kB 查看哈希值)

上传时间 Python 3

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