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BHMM: 用于单分子轨迹贝叶斯隐马尔可夫模型分析的工具包。

项目描述

本项目提供了估计亚稳态数量、状态间的速率常数、平衡种群、表征状态的分布以及从单分子数据中这些量分布的工具。这些数据可以是FRET数据、单分子拉伸数据或任何记录一个或多个可观察量随时间变化的任何数据。使用隐马尔可夫模型(HMM)来解释观测到的动力学,并使用贝叶斯推理技术和马尔可夫链蒙特卡洛(MCMC)从适合数据的模型分布中进行抽样,允许表征模型的不确定性,并通过新实验建模预期信息增益。

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