与阻塞gzip流一起工作的实用程序。
项目描述
bgzip: 块gzip流
bgzip 为块gzip文件提供流。
底层使用Cython来绕过Python的GIL，提供快速、并行化的膨胀/压缩。
with open("my_bgzipped_file.gz", "rb") as raw:
with bgzip.BGZipReader(raw) as fh:
data = fh.read(number_of_bytes)
with open("my_bgzipped_file.gz", "wb") as raw:
with bgzip.BGZipWriter(raw) as fh:
fh.write(my_data)
安装
pip install bgzip
要求
bgzip 需要 openmp。在MacOS上，可以使用以下命令安装
brew install llvm
链接
错误
请将错误、问题、功能请求等报告到 GitHub。
致谢
getm 由 Brian Hannafious 在 UCSC基因组研究所 创建。
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bgzip-0.5.0.tar.gz的哈希值
| 算法 | 哈希摘要 | |
|---|---|---|
| SHA256 | 26ea6eed35ac43ea36cff828ca0f94925298ac21283cd0debaf072a92ac4be74 |
|
| MD5 | c0fcaa3e6a790030676a99f3717d1f8c |
|
| BLAKE2b-256 | 37197612e1cd0083502286b3d1ea3dd1da552ce3f96b4c8e810ef186dfce7d61 |