跳转到主要内容

BETSEE,生物电组织仿真引擎环境。

项目描述

BETSEE (BioElectric Tissue Simulation Engine Environment) 是一个开源的跨平台图形用户界面(GUI),用于 BETSE,这是一个用于生命科学中2D计算多物理场问题的有限体积仿真器 – 包括 电扩散电渗电泳电压门控离子通道基因调控网络,和 生化反应网络(例如,新陈代谢)。

BETSE一样,BETSEE是用纯Python 3实现的,可移植性强,通过GitLab-CI × Appveyor + py.test进行持续的压力测试,并按照BSD 2-clause许可自由分发。


安装

BETSEE可以通过以下任一方式全局安装:

  • [推荐] pip,标准的Python包管理器

    pip3 install betsee
  • Anaconda,第三方Python包管理器

    conda config --add channels conda-forge
    conda install betsee

有关详细信息,请参阅我们的安装说明[1]

许可证

BETSEE是开源软件,按照宽松的BSD 2-clause许可发布。BETSEE还包含在BSD兼容许可下发布的第三方资产,包括

引用

BETSE在我们介绍性论文中有正式描述。利用BETSEE(因此是BETSE)的第三方论文、论文和其它文本应理想地引用以下内容

Alexis PietakMichael Levin,2016. Exploring instructive physiological signaling with the bioelectric tissue simulation engine (BETSE). (补充材料). [2] Frontiers in Bioengineering and Biotechnology, 4(55). https://doi.org/10.3389/fbioe.2016.00055

有关更多材料,请参阅这个BETSE相关论文列表

作者

BETSEE得益于一群作者贡献者——没有他们,该项目在计算上会变得贫乏,在生物上不匹配,并且根本无法使用。

谢谢大家。

资助

BETSEE目前作为一个志愿开源项目独立融资。之前的资助来源包括(按时间顺序):

  1. 在2017年至2019年的三年期间,BETSEE荣幸地与保罗·艾伦发现中心塔夫茨大学建立了联系,并得到了保罗·艾伦发现中心奖的支持,该奖项由保罗·G·艾伦前沿集团提供。

项目详情


下载文件

下载适用于您的平台的文件。如果您不确定选择哪个,请了解更多关于安装包的信息。

源分布

betsee-1.1.1.0.tar.gz (378.6 kB 查看哈希值)

上传时间:

构建分布

betsee-1.1.1.0-py3.6.egg (894.0 kB 查看哈希值)

上传时间:

betsee-1.1.1.0-py3-none-any.whl (521.8 kB 查看哈希值)

上传时间: Python 3

由以下支持

AWS AWS 云计算和安全赞助商 Datadog Datadog 监控 Fastly Fastly CDN Google Google 下载分析 Microsoft Microsoft PSF 赞助商 Pingdom Pingdom 监控 Sentry Sentry 错误记录 StatusPage StatusPage 状态页面