BETSEE,生物电组织仿真引擎环境。
项目描述
BETSEE (BioElectric Tissue Simulation Engine Environment) 是一个开源的跨平台图形用户界面(GUI),用于 BETSE,这是一个用于生命科学中2D计算多物理场问题的有限体积仿真器 – 包括 电扩散,电渗,电泳,电压门控离子通道,基因调控网络,和 生化反应网络(例如,新陈代谢)。
与BETSE一样,BETSEE是用纯Python 3实现的,可移植性强,通过GitLab-CI × Appveyor + py.test进行持续的压力测试,并按照BSD 2-clause许可自由分发。
安装
BETSEE可以通过以下任一方式全局安装:
许可证
BETSEE是开源软件,按照宽松的BSD 2-clause许可发布。BETSEE还包含在BSD兼容许可下发布的第三方资产,包括
所有Entypo+图标,与BETSEE一起分发,由Daniel Bruce友好地CC BY-SA 4.0许可发布。
所有Noun Project图标,与BETSEE一起分发,由多个作者在CC BY 3.0许可下友好地发布,包括
Maxim Kulikov,他是这个项目页面上突出显示的salubrious bovine的作者。
所有Open Iconic图标,与BETSEE一起分发,在MIT许可下友好地发布。
引用
BETSE在我们介绍性论文中有正式描述。利用BETSEE(因此是BETSE)的第三方论文、论文和其它文本应理想地引用以下内容
Alexis Pietak 和 Michael Levin,2016. Exploring instructive physiological signaling with the bioelectric tissue simulation engine (BETSE). (补充材料). [2] Frontiers in Bioengineering and Biotechnology, 4(55). https://doi.org/10.3389/fbioe.2016.00055
有关更多材料,请参阅这个BETSE相关论文列表。
本文的补充内容通过严谨的数学、形式化和抽象处理,扩展了本文提出的简要理论,以全面重现这项工作。如果完成主要文章后仍有理论疑问,请参阅本补充内容。
资助
BETSEE目前作为一个志愿开源项目独立融资。之前的资助来源包括(按时间顺序):
在2017年至2019年的三年期间,BETSEE荣幸地与保罗·艾伦发现中心在塔夫茨大学建立了联系,并得到了保罗·艾伦发现中心奖的支持,该奖项由保罗·G·艾伦前沿集团提供。
项目详情
下载文件
下载适用于您的平台的文件。如果您不确定选择哪个,请了解更多关于安装包的信息。
源分布
构建分布
betsee-1.1.1.0.tar.gz的哈希值
算法 | 哈希摘要 | |
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SHA256 | a5331f5bf5ace5794e60c91cda3e08f31beb5edde8ae99bee558a879d4167122 |
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betsee-1.1.1.0-py3.6.egg的哈希值
算法 | 哈希摘要 | |
---|---|---|
SHA256 | 9e05e873efe901dccc4d3a4766cae7d04110bb5b558f63aad34a94bf72fae9da |
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betsee-1.1.1.0-py3-none-any.whl的哈希值
算法 | 哈希摘要 | |
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SHA256 | c20ec21f3c29b6e141ec6fc3d237bd64372ca6cb813a33980720effcf6d2dd20 |
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