baredSC：单细胞表达分布的贝叶斯方法

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baredSC

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baredSC（贝叶斯方法获取单细胞表达分布）是一种工具，它使用蒙特卡洛马尔可夫链来估计概率密度函数（PDF）的置信区间，该函数用于估计一个或两个基因的单细胞RNA-seq数据中的表达。它使用每个细胞的原始计数和UMI总数。PDF通过用户提供的1d或2d高斯函数近似。似然度估计使用假设原始计数遵循等于细胞中基因mRNA比例乘以在此细胞中识别到的UMI总数泊松分布的参数。

文档

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引用

如果您使用baredSC，请引用我们的bioRxiv论文。

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