axographio 0.3.2

获取 axographio

axographio 与 Python 2 和 Python 3 都兼容。

获取 axographio 的最简单方法是使用 pip 安装最新稳定版本，但您也可以从源代码构建它。

pip install axographio

pip install git+https://github.com/CWRUChielLab/axographio

pip install C:\wherever-you-put-the-source-code

用法

尝试 Binder 演示，这是一个无需安装或烦恼的交互式 Python 会话。您现在就可以开始编码了！

加载数据文件就像调用 read 一样简单

>>> import axographio
>>>
>>> f = axographio.read('AxoGraph X File.axgx')

此时，变量 f 将包含一个 file_contents 对象，其中包含文件中的列名和数据。例如，您现在可以使用 Matplotlib 绘制前两列

>>> import matplotlib.pyplot as plt
>>>
>>> plt.plot(f.data[0], f.data[1])
>>> plt.xlabel(f.names[0])
>>> plt.ylabel(f.names[1])
>>> plt.show()  # may be optional depending on your OS

当然，您可能不仅仅想绘制数据。列数据支持标准的序列接口（即索引、迭代等），可以使用这些包中的 asarray 函数将其转换为 NumPy 或 SciPy 数组，例如。

>>> import numpy as np
>>>
>>> times = np.asarray(f.data[0])

写入文件相对简单。您只需创建一个新的 file_contents 对象（或使用您之前加载的一个），然后调用 write。例如，以下代码在当前目录中创建一个名为‘my60Hz.axgx’的文件，包含两个60 Hz的正弦波通道

>>> import axographio
>>> import numpy as np
>>>
>>> times = np.arange(0, 10, 0.0001)
>>> column1 = np.sin(2*np.pi * 60 * times)
>>> column2 = np.cos(2*np.pi * 60 * times)
>>> f = axographio.file_contents(
...    ['time (s)', 'my recording (V)', 'your recording (V)'],
...    [times, column1, column2])
>>> f.write('my60Hz.axgx') # created in the current directory

问题和支持

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更改

致谢

本项目最初在凯斯西储大学的Chiel实验室编写，得到了NIH资助项目NS047073、俄亥俄州创新激励奖奖学金和凯斯西储大学MSTP（NIH T32 GM007250）的支持。本项目建立在许多其他开源项目之上，包括Python、C++ AxoGraph文件输入/输出代码（置于公有领域；项目源代码中包含修改版本）、Cython等。还要感谢Hillel Chiel博士提供测试和有益的建议。