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ASLPREP是一个强大且易于使用的ASL数据处理流程。

项目描述

动脉自旋标记(ASL)预处理涉及众多步骤,以在统计分析前清理和标准化数据。通常,研究人员为每个数据集创建定制的预处理工作流程,基于大量现有工具。随着采集和处理技术的快速发展,这些工作流程的复杂性也在增加。ASLPrep是一个不针对特定分析的工具,用于解决基于任务和静息态ASL数据稳健且可重复的预处理挑战。ASLPrep会自动将最佳工作流程适应几乎任何数据集的独特性,确保高质量的预处理而无需人工干预。ASLPrep在多种ASL数据上稳健地产生高质量的结果。此外,ASLPrep引入的空间平滑度比常用预处理工具观察到的要低。ASLPrep为神经科学家提供了一个易于使用且透明的预处理工作流程,有助于确保推断的有效性和结果的可解释性。

工作流程基于Nipype,包含来自知名神经影像软件包的大量工具,包括FSLANTsFreeSurferAFNINilearn。该流程旨在为预处理每个阶段提供最佳软件实现,并将随着更先进和更好的神经影像软件的可用性进行更新。

ASLPrep执行基本的预处理步骤(配准、归一化、去扭曲、分割、颅骨剥离和计算脑血流量(CBF)),提供可轻松提交给各种组级分析的输出,包括基于任务的或静息态CBF、图论度量、基于表面或体积的统计等。ASLPrep允许您轻松执行以下操作

  • 将ASL数据从未处理(仅重建)转换为分析准备状态。

  • 计算脑血流量(CBF)、去噪和部分体积校正

  • 实现来自不同软件包的工具。

  • 通过使用最佳工具实现最佳数据处理质量。

  • 生成预处理评估报告,用户可以轻松识别问题。

  • 接收有关每个受试者预处理阶段的详细输出,包括有意义的错误。

  • 自动化和并行化处理步骤,这可以从典型的线性、手动处理中显著提高速度。

[文档aslprep.org ]

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