anjl - Python的邻接连接库

anjl是一个Python包，提供了Saitou和Nei的邻接连接算法的实现和一些相关实用工具。

安装

pip install anjl

用法

import anjl

标准的邻接连接实现

help(anjl.canonical_nj)

转换为树形数据结构

help(anjl.to_tree)

使用等角布局绘制树

help(anjl.plot_equal_angles)

关于

在BioPython、scikit-bio和biotite中都可以找到邻接连接的实现，但它们对于大量节点来说相对较慢。我创建了此包，以提供用于人口基因组学的更快的实现。

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