aiida_conda_scheduler

AiiDA调度插件，允许使用conda run。

目前，截至aiida-core v2.0.1，无法设置一个可以运行的Computer + Code，例如

conda run --name myenv mpirun -np 4 pw.x -i input.in

因为，(a) 代码只能指定remote_abs_path，(b) 只有计算机可以指定mpirun_command。

这是在不使用Conda base环境运行代码的唯一方法，因为conda activate myenv（也许可以添加到prepend_text）在脚本中运行时会失败。

这些调度插件继承内置调度子类，并重写_get_run_line方法

1. 如果len(codes_info) != 1或codes_run_mode != CodeRunMode.SERIAL（即仅支持一个代码），则抛出NotImplementedError
2. 从codes_info[0].code_uuid加载代码并检索其描述
3. 使用此描述通过查找env=myenv来确定环境名称
4. 将conda run --name myenv 追加到运行行。

安装

pip install aiida_conda_scheduler
reentry scan  # aiida v1.x only

然后插件应显示在

verdi plugin list aiida.schedulers

开发

使用pipx安装tox和pre-commit命令工具。

git clone https://github.com/chrisjsewell/aiida-conda-scheduler .
cd aiida-conda-scheduler
pre-commit run --all
tox

对于aiida-core v1，例如使用

tox -e py38-v1

许可证

MIT

联系方式

chrisj_sewell@hotmail.com